В это время в космосе Двенадцатая планета, следуя по своей орбите вытянутого эллипса, приближалась к Месту Пересечения плоскости планет солнечной системы. Угол орбиты Нибиру к этой плоскости составляет 33 градуса, а сама точка Пересечения находится между Юпитером и Сатурном. В точке максимальной близости к Земле мощное гравитационное поле громадной планеты Нибиру вызывало сильнейшие землетрясения и другие явления глобального масштаба, воздействуя также и на земную орбиту. По математическим расчетам нефилимов, на этот раз нестабильный ледяной покров Антарктического материка соскользнет в океан, и это станет причиной мирового Потопа. Сами астронавты не могли чувствовать себя в безопасности на Земле, и с приближением Двенадцатой планеты решили подняться на орбитальную станцию.
Все ануннаки собрались в окрестностях космодрома, ожидая отправления на орбитальную станцию, но подготовка космических кораблей для старта велась в строжайшем секрете от людей. Энлиль привел к присяге молчания всех нефилимов. Он решил: «Пусть погибнут эти развратные создания, пусть исчезнут эти люди-животные, пусть семя их с лица земли вода сотрет».
Однако в городе Шуруппаке, городе, где правила Нинхурсаг, установились довольно близкие отношения между людьми и богами. В Шуруппаке впервые за всю историю Земли человек был возведен в статус царя. Царь по имени Зиусудра, видя страдания своего народа, обратился за помощью к Энки. Эа, питая слабость к роду человеческому, не раз помогал людям города Шуруппака, щедро оделяя их своей морской добычей и спасая их от голодной смерти. Но на этот раз встал вопрос о полном уничтожении человечества, в связи с надвигающимся Потопом. Энки думал: «Погибнет ли изобретение Энки и Нинхурсаг, обратившись в прах, как того желал Энлиль, или же семя человеческое сохранится на Земле?»
Но даже связанный клятвой, Энки все же нашел способ спасти человечество. Однажды царь Зиусудра вновь пришел в храм Энки и начал молить бога об окончании страданий человеческих. Энки приказал ему стать за ширмой, а затем, притворившись, будто бы он разговаривает сам с собой, Энки предупредил Зиусудру о надвигающейся катастрофе:
«Оставь свой дом, построй корабль большой! Расстаться с нажитым спеши и не спеши расстаться с жизнью! Оставь земное бремя, спаси живую душу! И на корабль возьми с собой земных всех тварей семена; и тот корабль, что ты построишь, — без исключения, он вместит всех».
Гигантский «Корабль», Ковчег, построенный Зиусудрой, в действительности был подводным судном, своего рода «субмариной», способной противостоять натиску разбушевавшихся вод. В шумерских текстах сохранились даже такие детали, как размеры этого корабля, а также подробное описание его палуб и отделений. Энки дал в помощь Зиусудре опытного кораблестроителя. А когда Ковчег был построен, то Эа дал команде подводной лодки навигатора, предварительно рассказав ему, как привести судно прямо к «Горе Спасения», к горе Арарат. Вершины Арарата, высочайшего на Ближнем Востоке горного комплекса, должны были по окончании Потопа первыми показаться из-под воды.